Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms