Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HLA-DMAP28067 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms