Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFP26441 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFP26441 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFP26441 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFP26441 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTFP26441 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFP26441 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFP26441 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFP26441 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFP26441 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFP26441 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFP26441 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFP26441 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFP26441 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFP26441 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFP26441 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFP26441 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFP26441 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFP26441 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFP26441 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTFP26441 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms