Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRPH2P23942 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms