Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ME2P23368 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ME2P23368 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ME2P23368 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms