Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOP2AP11388 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOP2AP11388 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms