Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM228BP0C875 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM228BP0C875 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms