Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHOP08100 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RHOP08100 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RHOP08100 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RHOP08100 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms