Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERPIND1P05546 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SERPIND1P05546 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms