Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPBO95292 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPBO95292 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPBO95292 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPBO95292 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPBO95292 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPBO95292 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPBO95292 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPBO95292 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPBO95292 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPBO95292 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPBO95292 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPBO95292 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAPBO95292 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms