Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC7A4O43246 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC7A4O43246 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC7A4O43246 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC7A4O43246 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms