Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GOLGA6L9A6NEM1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms