Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms