Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HIF3AQ9Y2N7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HIF3AQ9Y2N7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HIF3AQ9Y2N7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HIF3AQ9Y2N7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HIF3AQ9Y2N7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HIF3AQ9Y2N7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HIF3AQ9Y2N7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HIF3AQ9Y2N7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HIF3AQ9Y2N7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HIF3AQ9Y2N7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HIF3AQ9Y2N7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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