Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HPS5Q9UPZ3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HPS5Q9UPZ3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms