Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRPF3Q9ULD4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms