Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLKQ9UBT6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms