Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00474Q9P2X8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms