Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDE1Q9NXR1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDE1Q9NXR1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDE1Q9NXR1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDE1Q9NXR1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDE1Q9NXR1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDE1Q9NXR1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDE1Q9NXR1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDE1Q9NXR1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms