Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms