Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC22A11Q9NSA0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms