Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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