Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCL2

GPAM, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAMQ9HCL2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPAMQ9HCL2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPAMQ9HCL2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms