Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms