Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZYG11BQ9C0D3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms