Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ROPN1BQ9BZX4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms