Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms