Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LPIN3Q9BQK8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms