Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms