Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3Q96DC8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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