Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms