Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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GTF3C6Q969F1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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GTF3C6Q969F1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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GTF3C6Q969F1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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GTF3C6Q969F1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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GTF3C6Q969F1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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