Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms