Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRUQ92729 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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PTPRUQ92729 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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PTPRUQ92729 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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PTPRUQ92729 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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PTPRUQ92729 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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PTPRUQ92729 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PTPRUQ92729 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PTPRUQ92729 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRUQ92729 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PTPRUQ92729 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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PTPRUQ92729 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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PTPRUQ92729 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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PTPRUQ92729 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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PTPRUQ92729 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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PTPRUQ92729 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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