Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERVK_113Q902F9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113Q902F9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms