Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms