Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms