Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ANKRD40Q6AI12 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms