Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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