Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PHYHD1Q5SRE7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms