Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms