Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms