Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC38Q502W7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms