Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms