Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL38Q2WGJ6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms