Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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