Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC142Q17RM4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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