Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms