Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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RTN1Q16799 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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RTN1Q16799 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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