Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FXNQ16595 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.05■□□□□ 0
FXNQ16595 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FXNQ16595 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FXNQ16595 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
FXNQ16595 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FXNQ16595 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FXNQ16595 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FXNQ16595 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FXNQ16595 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FXNQ16595 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms